军事基地被袭击，凶手已经被确定为在博物馆工作的夜班警卫，亚裔男子麦克·华，只是在此之后，该人查无踪影，就此销声匿迹。
多年寻找之后，任凭丑国情报机构在全世界挖地三尺，花费了大量人力物力，也没能找到对方的任何踪迹，久而久之，这件事就渐渐尘封。
那金属手臂则被送往51区，严密保护起来，军方科学家也对其开展逆向研究，根据金属手臂中的独立芯片，完善了当前最为先进的人工智能，有了人工智能独立意识的雏形。
这个研究计划，被军方命名为‘天网计划！’
军方希望利用天网建立全自动化的防御网络系统，以避免人类性格的天然缺陷而导致的执行力不足。
但是天网的自我意识觉醒并完善之后，却将人类判定为对自身的威胁，进而发动了核战，将大部分人类消灭。
核战过后，人类的大城市被核弹精准打击，尽数摧毁，人类伤亡惨重。
可屋漏偏逢连夜雨，在纽约附近未被核弹波及的原始森林里，一只名叫‘凯撒’的黑猩猩，带着族群走出了森林。
凯撒有比人类还要高的智商，它经过分析认为，天网是不可战胜的，所以带领族群在和人类的战争中，取得了一定战果之后，就立刻投靠了天网，跪地发誓向其效忠。
当时幸存的人类组成了反抗军，在约翰·康纳的领导下同天网生产的机器人作战。
约翰·康纳有极高的战术素养，在他的带领下，反抗军高歌猛进，成功攻占了天网位于科罗拉多州的夏延山基地。
天网意识到约翰的巨大威胁，它一方面接受了猿人一族的投靠，另一方面派出t1000液态金属机器人，想要通过天网刚研发出来不久的时间机器，回到约翰·康纳小的时候提前清除威胁。
而猩人方面也被天网下令，需要派出人手协助t1000回到未来完成任务。
身处夏延山基地的反抗军，通过基地原本的系统，截获了猿人与天网的通讯信息，他们知道必须出手阻止天网和猿人的阴谋，否则约翰·康纳将被灭杀在过去，没了指挥官的领导，人类将万劫不复。
约翰·康纳和一众反抗军高层研究之后，当即便决定利用夏延山基地内的时空机器，把被缴获过来重新写入程序的t800机器人送回到过去阻止t1000，保护少年时期的约翰·康纳。
因为夏延山基地里存有关于天网前世今生的所有资料，所以反抗军也得到了有关华十二的信息，知道这是一个疑似拥有外星科技，可以以一人之力，摧毁一座军事基地的猛人。