派魏学曾去事权不一，更何况一人主和，一人主战必会起争执。
但是林延潮此论被兵部尚书石星反对，石星以陕西巡抚叶梦熊弹劾郑洛，以及众言官们弹劾郑洛为理由于廷议与林延潮争论。次辅许国支持了石星之见，启用魏学曾为三边总督。
数日后国子监祭酒出缺，右谕德萧良有由其老师刘虞夔，吏部尚书陆光祖与林延潮推举，而另一边则是詹事兼侍讲学士刘震元相争，许国石星意许刘震元，最后在九卿会推上，萧良有以微弱票数获胜，被天子钦点为国子监祭酒。
这边林延潮不能舒展，在另一边言官弹劾申时行已到了高潮。
首先是御史李用中弹劾申时行指示家人申柄以及其母舅居乡横行霸道之事。
申时行上疏自辩，同时请求辞职。
而福建按察副使李琯弹劾申时行十罪。
这十罪将申时行为首辅十年的‘罪名’一一列举，一帝寝漏水，二在外散布天子意图易储的谣言，图谋拥立之功，三请圣谕将言官罚俸一年，四将言官弹劾申时行的奏疏留中不下，五次子申用嘉冒籍，女婿李鸿顺天乡试舞弊得中，六家人宋九以贿赂任京营经历，还冒支双俸，七收受前三边总督郜光先的贿赂，使河洮二州沦陷于火落赤部，八收受李成梁贿赂以败报捷，九……十……
此疏一上，京城震动，若是之前言官弹劾都是一条两条，这十罪一上就是总攻了。更何况李琯还是申时行半个门生。
申时行闻此坚决辞相，天子下旨将李琯革职外，继续挽留申时行。
不过这时候谁都知道申时行去位在即了。
现在内阁之中由于申时行坚决在家，王锡爵又回去了，只剩下许国，王家屏二人，当时有人建议许国向天子题请增补阁臣，许国却是不肯。
这日林延潮又在廷议与石星争执，原来福建巡抚赵参鲁来报说倭国意欲联合琉球进兵，林延潮提出早作准备加强防备，石星却主张应先西后东，朝廷先将精力都集中在平定火落赤部的叛乱上。
二人之间的争执，最后又以许国支持石星作为结局。
廷议结束的一刻，林延潮从座椅上喝茶，倒是没说什么。
却见许国脸上倒是隐隐有几分笑容，更有几分得意，然后与王家屏闲聊。
林延潮看了空悬的主位，以及坐在次席的许国。以往廷议上，尽管申时行为首辅，自己尚且不得伸展，现在许国主持廷议就更难了。
林延潮当即站起身来，向许国拱了拱手表示告辞。
许国表面挽留道：“大宗伯何必走得如此着急，一会我等还有石大司马在东阁再聊一聊。”
林延潮道：“衙门里还有事不敢耽搁。”
许国点点头道：“也好，本辅