后面的拳民也纷纷下跪向李经述求饶。李经述想了一会，说：“饶恕你们，也并非不可。你们这些拳民，就去现身说法，将功补过，到乡下为山东父老戳穿大师兄刀枪不入的谎言。至于陈长寿你们这些乡绅，就有钱的出钱，有力的出力，帮助拳民们现身说法。如果你们能劝全省的拳民向善，本官就饶你们不死，否则，你们就在大牢里等着，秋后问斩吧！”
二师兄和拳民们，还有乡绅们纷纷点头答应下乡去现身说法。当日去巡抚府衙的，都是拳匪的骨干分子，他们现身说教，李经述很快遏制住了拳匪之乱。李经述深感在1892年，封建迷信盛行，跟当时的教育内容落后有关系，便决定下一步从教育入手，开始在山东的新政。
李经述深知山东这样一个大省要稳定，需把“枪杆子”牢牢抓在手里，而且兵贵乎精，不在多，他除了把天津训练的新军调了一万驻防山东，还裁撤了山东原有的四万兵勇，精选一万人，组成二十营，将省下的军饷全部换上洋枪洋炮，集中到济南，让王士珍负责训练，并把北洋水师的“定远”号调到山东威海驻防。
大局稳定之后，李经述首抓的第一件事，就是兴教育，启民智，也就是解放民众的思想。山东当时的教民达五千人，儒家文化和基督教文明产生剧烈冲突，表面上被李经述强力压制下去，但矛盾依然存在。
李经述认同李提摩太的看法，准备通过教育使民众对科学产生兴趣，招募他们去修建铁路、开掘矿藏，避免饥荒再度发生，把民众从“赤贫之境”解救出来，这样“釜底抽薪”，可以彻底铲除封建迷信带来的“拳匪之乱”，减少仇洋排外事件。
李经述一到山东，就创立了山东大学堂，邀请李提摩太担任山东大学堂的西学书斋总理，相当于现在的山东大学校长，由谭嗣同担任副校长，没想到，李提摩太刚到济南，就跟谭嗣同起了理念上的冲突，就西方文明和中华文明孰优孰劣，进了唇枪舌剑的辩论。
关于文明冲突论，美国当代著名的政治思想家、国际政治理论家塞缪尔·亨廷顿有一个关于“文明冲突论”的理论，被很多学者认同：他从贫穷落后国家存在的实际情况出发，提出了贫穷落后国家走向现代化的“强政府理论”，主要内容是说贫穷落后国家在进行现代化变革的过程中，要根除国内政治的动荡和衰朽，就必须建立起强大的政府，舍此无他路可走。
亨廷顿在《文明冲突和世界秩序重建》一书中系统地提出“文明冲突论”：认为世界格局的决定因素表现为七大或八大文明，即中华文明、日本文明、印度文明、***文明、西方文明、东正教文明、拉美文明，还有可能存在的非洲文明。文化方面的差异，将主宰全球的冲突。
在亨廷顿看来，主要文明之间的相互作用将决定未